南京海昌中药集团为南京中医药大学与南京高新技术经济开发总公司合作，于2008年6月，在南京高新技术产业开发区内成立的，以现代中药饮片、中成药及其设备的研发、生产与制造为核心内容的产、学、研紧密结合的高新技术企业。公司注册资金为1亿元人民币，是现代中药的产、学、研联合示范工程。集团主要研发、生产标准中药饮片、现代中成药、中药加工炮制器械、提取分离设备等。集团拥有南京海昌中药集团研究院以及南京海源中药饮片有限公司、江苏海昇药业有限公司、杭州海善制药设备有限公司3家子公司。


南京海源中药饮片有限公司具有通过国家GMP认证、综合实力处于国内领先水平8条装备信息化管理系统的中药饮片生产线，拥有包括中药材前处理、炒制、蒸制、蜜制、酒制、醋制、盐制、煅制、麸制等10个独立的生产区间，年产高品质标准中药饮片3000吨。


江苏海昇药业有限公司拥有通过国家GMP认证的制剂车间1.4万平方米，可生产酒剂、片剂、颗粒剂、口服液、糖浆剂等九大类剂型40余个名优中成药品种。主要是以妇科、皮肤科、呼吸系统类、滋补类为主导品种，主要产品为参蓉健腰酒、精血补片、产后康膏、五妙水仙膏、康媛颗粒、参茸酒、健脾壮腰药酒、丹参口服液、抗感冒颗粒、姜枣祛寒颗粒、藿香水等，可年产片剂10亿片、颗粒剂4,000万袋、胶囊剂2亿粒、丸剂600万瓶、口服液2,500万支、糖浆剂1,000万瓶、酒剂500万瓶、煎膏剂150万瓶、外用涂膏剂100万支。另有一条新建成的食品生产线，年生产能力可达8亿元。


杭州海善制药设备有限公司拥有42%的国家行业药机产品标准。获30多项国家发明和实用新型专利，主要产品包括挑选、净选、风选、筛选、洗净、烘干、切制、炒制、浸润、蒸煮、提取、浓缩、破碎、粉碎等全套十五个大类总计上百个品种和规格的系列产品，是全国参加制定中医药国际标准的制药设备企业。


南京海昌中药集团是南京中医药大学中药学国家一级重点学科人才培育的创新创业载体，是国家教育部中药炮制规范化及标准化工程研究中心、国家科技部中药饮片质量标准研究平台及国家中医药管理局中药炮制标准重点研究室的产业化基地、国家标准化管理委员会全国中药炮制机械标准化分技术委员会依托单位，也是江苏省中药（饮片）规范化及产业化工程研究中心和江苏省产、学、研示范基地。2011年，公司被评为“江苏省企业”和“亚洲十大具潜力品牌”企业。


南京海昌中药集团面向新兴的现代中药产业，正在从绿色中药材GAP基地建设，中药材及饮片产地加工炮制、中药炮制设备的智能化开发、现代中药饮片的研制，原创中药新药的研发等产业链的多个层面展开攻关，旨在建立优质标准中药饮片的生产体系、饮片质量标准评价体系及现代中成药的创新体系；进一步完善中药材及饮片产地加工炮制一体化设备、中药提取分离设备、高等院校和科研院所实验及中试的器械设备等，构建现代中药质量控制的技术高地，生产国内外一流的标准中药饮片和现代中成药，争创产、学、研一体化的特色中药企业。